Keywords
Bakteriemembran
Optisk pincet
How to Cite
Abstract
Med udgangspunkt i den optiske pincets harmoniske potentiale demonstrerer Lene Oddershede, hvordan man eksperimentelt kan måle enkeltproteiners dynamik i bakteriemembraner med nanometers præcision. Artiklen kobler elegant statistisk fysik og biofysik ved at udlede sammenhængen mellem positionsfordeling, fjederkonstant og termiske fluktuationer via 𝑘_B T. Gennem en model med koblede fjederkonstanter beskrives samspillet mellem protein, biotin-streptavidin-binding og cellevæg. Læseren føres fra eksperimentel opstilling til fysisk modellering og udledning af friktionskoefficient og diffusionskonstant. Artiklen er et fremragende eksempel på, hvordan klassiske fysikbegreber som harmoniske oscillatorer og Gaussiske fordelinger bliver operative værktøjer i moderne biologisk fysik.
References
[1] L. Oddershede, J. K. Dreyer, S. Grego, S. Brown og K. Berg-Sørensen (2002). "The Motion of a Single Molecule, the λ-receptor, in the Bacterial Outer Membrane". Indsendt, kan rekvireres ved henvendelse til oddershede@nbi.dk.
https://doi.org/10.1016/S0006-3495(02)75318-6
[2] L. Oddershede, S. Grego, S.F. Nørrelykke og K. Berg-Sørensen (2001). "Optical Tweezers: Probing Biological Surfaces". Probe Microscopy, bind 2, side 129-137.
[3] J. K. Dreyer (2001) "A single molecule study by optical trapping and Single Particle Tracking.", Speciale, Niels Bohr Institutet. Kan rekvireres ved henvendelse til kisbye@nbi.dk.
[4] F. Gittes og C. F. Schmidt (1998) "Signals and Noise in Micromechanical Measurements." Methods in Cell Biology, bind 55, side 129-156.
https://doi.org/10.1016/S0091-679X(08)60406-9
[5] J. Gabay og K. Yasunaka (1980) "Interaction of the LamB Protein with the Peptidoglycan Layer in Escherichia coli K12." Eur. J. Biochem., bind 104, side 13-18.
https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1980.tb04393.x
[6] I. M. Peters, Y. van Kooyk, S. J. van Vliet, B. G. de Grooth, C. G. Figdor og J. Greve (1999) "3D Single-Particle Tracking and Optical Trap Measurements on Adhesion Proteins." Cytometry, bind 36, side 189-194. [7] På optisk pincet gruppens hjemmeside www.nbi.dk/tweezer under research menuen, omtalte projekt, er en film, der viser hvorledes λ-receptoren bevæger sig i bakteriemembranen.
https://doi.org/10.1002/(SICI)1097-0320(19990701)36:3<189::AID-CYTO7>3.0.CO;2-3
[8] K. Svoboda og S. M. Block (1994). "Biological applications of optical forces." Ann. Rev. Biophys. Biomol. Struct., bind 23, side 247-285.
https://doi.org/10.1146/annurev.bb.23.060194.001335
[9] K. Berg-Sørensen (2000) "Den optiske pincet i biologisk fysik", Gamma, bind 119, side 11-17.
Counting from volume 37 (2026 -), articles published are licensed under Creative Commons Attribution-NonCommercial CC BY-NC 4.0.
Articles in volume 1-36 (1990 - 2025) are not licensed under Creative Commons. In these volumes, all rights are reserved to the authors of the articles respectively.